Nuovo Virus Cinese

**burian br** · 29/05/2020, 19:04

Alcune novità dal fronte filogenetico.

Tempo addietro, vi avevo parlato del possibile pattern di diffusione del virus, che è possibile far risalire a due areali principali per quanto concerne il ceppo europeo/atlantico:

Europa meridionale, con al centro dell'espansione ovviamente l'Italia
Europa centro-settentrionale, nello specifico la Francia settentrionale

Sono queste due aree geografiche che hanno dato vita alle epidemie sparse per il pianeta, con pattern anche molto differenti a breve distanza geografica, come vedrete a breve.

Vi preannunciai che dalla Francia il virus, giunto precocemente dall'Italia appena due se non una sola settimana dal suo arrivo nel nostro Paese, si era espanso per contiguità seguendo le coste del mare del Nord e poi quelle baltiche.
Lo si ritrova in Belgio e Olanda (dove ha dato vita a un proprio ramo che vi misi in evidenza nel più grosso ramo americano derivato dal virus francese) e poi in Danimarca.

In Svezia ha avuto vita prospera, tanto che ritroviamo un ramo esclusivamente svedese. Possiamo immaginare si sia diffuso dalla Danimarca, perchè a monte di questo ramo c'è appunto un virus isolato in Danimarca, che si presenta dunque come genitore diretto di quello diffuso in Svezia:

Screenshot_2020-05-29 Nextstrain ncov global(1).png

Il virus si è propagato anche in Norvegia, dove lo troviamo isolato recentemente.
La situazione scandinava è curiosa: il virus è giunto nel Baltico prima dall'Italia, e ha avuto modo di diffondersi. Lo stesso in Belgio e Olanda. Eppure nell'ultimo mese è aumentata la frequenza del virus originario dalla Francia, come se quello italiano stesse "soccombendo" numericamente rispetto a quello francese. Ma forse è solo un caso. Fatto sta che è quanto si nota anche in Norvegia, oltre che in Svezia.
In Lettonia invece isolati solo virus italiani. Non deve aver fatto in tempo a giungere lì con i vari lockdown.
Il virus francese è arrivato anche in Finlandia, ma non sappiamo se si sia diffuso a scapito di quello preesistente di origine italiana, perchè la Finlandia non pubblica genomi da quasi due mesi.
La domanda che mi pongo è: potrebbe essere il virus sorto in Francia e diffuso in USA ancor più contagioso?

A potenziale sostegno sempre di questa tesi, il fatto che il Cile, fino a poco tempo fa sede unicamente del ceppo pacifico/cinese, è ormai unicamente sotto scacco del virus del ceppo europeo. E fin qui nulla di nuovo, ma pur essendo diffusi sia il virus italiano sia quello francese, quest'ultimo mi sembra predominare, e ha detto vita a questo ramo unicamente cileno:

Screenshot_2020-05-29 Nextstrain ncov global(2).png

Ho solo esposto, ci tengo a sottolineare, questa ipotesi, perchè non abbiamo prove per dire sia così, e non la avvallo, ma solo avanzo l'idea. Infatti ci sono tantissimi fattori che potrebbero spiegare la prevalenza in apparenza maggiore del virus sorto in Francia: semplicemente il caso. O magari si isolano più virus da una data regione di quello stato dove è prevalente per ragioni di introduzione temporale il virus francese. O ancora è solo un'impressione generata da un'insufficiente mole di dati. Oppure la vicinanza geografica a paesi in cui è più diffuso il virus francese: ad esempio in Svezia ci saranno state multiple introduzioni per via di viaggiatori danesi che hanno rinfocillato il numero di casi con quel virus rispetto a quanto avveniva con i casi del virus italiano, visto che con l'Italia i rapporti sono meno numerosi (tra l'altro ci hanno sospeso precocemente i collegamenti).

Cambiando luogo, passiamo a Israele. Anche qui è diffuso il virus francese, ma l'origine è evidentemente statunitense.

Screenshot_2020-05-29 Nextstrain ncov global.png

Si può capire benissimo da dove sia partita l'infezione in Israele. In verità Israele è un melting pot virale, ma nell'ultimo mese di Aprile questo ramo è stato quello più rappresentato sugli altri.

**TreborSnow** · 29/05/2020, 19:05

I lombardi già hanno cominciato ad uscire dalla regione, e subito "mazzate"...

Spostamenti tra Regioni, oltrepassano il confine tra Lombardia e Trentino con il kitesurf: multati sette ragazzi e due istruttori - Il Fatto Quotidiano

Questa è davvero ridicola però

**Meteo65** · 29/05/2020, 19:11

Originariamente Scritto da TreborSnow

I lombardi già hanno cominciato ad uscire dalla regione, e subito "mazzate"...

Spostamenti tra Regioni, oltrepassano il confine tra Lombardia e Trentino con il kitesurf: multati sette ragazzi e due istruttori - Il Fatto Quotidiano

Questa è davvero ridicola però

Non è solo ridicola, io la trovo assurda invece. Ma si sa, i comuni le inventano tutte pur di far cassa....e il covid è una buona scusa!

Però: Se stavano ammassati davanti a qualche pub o bar, non avrebbero avuto nessuna sanzione!!!

**burian br** · 29/05/2020, 19:12

Originariamente Scritto da Snowstorm84

In Danimarca hanno riaperto asili e primarie (fino a 11 anni) dal 15 aprile. In Germania scuole primarie aperte (ma con aperture diversificate tra i vari Lander ) tra il 20 aprile e il 4 maggio, in Norvegia idem dal 20 aprile. Qui addirittura hanno riaperto anche le scuole secondarie dall 11 maggio..anche se qui forse va aspettato un altro poco per trarre qualche conclusione.

Comunque ho letto che già in precedenza ricercatori ci.esi avevano pubblicato studi che vanno in quella direzione, purtroppo non ho i link sottomano.

Sì, c'era uno studio condotto ad esempio su un bambino che risultò positivo al Coronavirus in Francia e andò a scuola lo stesso. Nessun contagio.

Però come sempre sono studi condotti su un numero insufficiente di casi per trarre conclusioni definitive. Poi è davvero così, ma non possiamo ancora dirlo con certezza.

Grazie comunque di averlo postato. E' sempre un contributo importante

**burian br** · 29/05/2020, 19:14

Originariamente Scritto da simo89

Qualche commento?

No ma sono solo io a ritenerla una scelta al limite della follia?

Sono shockato

Hai ragione, condivido, ma tanto non siamo noi i politicanti.

**burian br** · 29/05/2020, 19:16

Originariamente Scritto da Meteo65

Vi state preoccupando se vengono da Lombardia o Liguria, mentre va benissimo, invece, se vengono dalla Francia o dalla Spagna, o dall'Inghilterra, se non addirittura dagli USA, vero?

Ah, sai già la mia posizione. Turismo straniero zero. E' la cosa peggiore che si può fare.

**Matëlmaire** · 29/05/2020, 19:16

Pubblicati dal sito ministeriale l'Rt della settimana 18-24 maggio: Report monitoraggio, al momento in Italia nessuna situazione critica

Molise 2.2 (CI: 1.5-3.33)
Umbria 0.94 (CI: 0.57-1.41)
Friuli-Venezia Giulia 0.9 (CI: 0.67-1.16)
PA Trento 0.88 (CI: 0.68-1.09)
Valle d'Aosta 0.8 (CI: 0.43-1.1)
Lombardia 0.75 (CI: 0.72-0.84)
Sicilia 0.75 (CI: 0.44-1.19)
Lazio 0.74 (CI: 0.57-0.92)
Abruzzo 0.67 (CI: 0.46-0.91)
Veneto 0.65 (CI: 0.49-0.83)
Puglia 0.62 (CI: 0.45-0.82)
Toscana 0.59 (CI: 0.47-0.83)
Liguria 0.58 (CI: 0.51-0.66)
PA Bolzano 0.57 (CI: 0.37-0.83)
Emilia-Romagna 0.55 (CI: 0.49-0.62)
Marche 0.55 (CI: 0.35-0.82)
Sardegna 0.51 (CI: 0.22-0.82)
Piemonte 0.5 (CI: 0.46-0.55)
Calabria 0.13 (CI: 0.01-0.35)
Basilicata 0 (CI: 0-0)
Campania in fase di definizione

Nelle prime cinque posizioni per rischio di contagio ci sono praticamente tutte le regioni più piccole/meno popolate d'Italia ad eccezione della Basilicata.

Comunque, stando solo all'analisi dei dati dell'Rt, il Piemonte e l'Emilia-Romagna potrebbero stare in una botte di ferro.

**burian br** · 29/05/2020, 19:21

Ed ecco l'India oggi, sta esplodendo ormai:

+7936 casi (tot. 173.322)
+268 morti (tot. 4979)

Non ci siamo per niente...è una polveriera pronta a causare un disastro umanitario.
Potrebbero morire, secondo le mie stime, in uno scenario di immunità di gregge all'80% (il peggiore) fino a 6-7 milioni di persone.

**Meteo65** · 29/05/2020, 19:22

Originariamente Scritto da burian br

Ah, sai già la mia posizione. Turismo straniero zero. E' la cosa peggiore che si può fare.

In che senso la cosa peggiore che si puo fare?

Io non mi aspetto, in generale, un afflusso di turisti dall'estero come nella norma, non quest'anno....però un turismo dalla Lombardia o dalle altre regioni, si.
L'estate è alle porte, e da qui a fine giugno tutto puo migliorare come anche peggiorare....chi lo sa...però se dovesse andare meglio, sono tutti benvenuti qui

E per me va benissimo così