Nuovo Virus Cinese

[burian br]

Esiste anche uno studio che testimonia la presenza di tracce di SARS-CoV2 nelle acque reflue di Barcellona a metà Gennaio.

Sapete già come la penso. Per me questi studi sono in contrasto con quanto la letteratura scientifica sa circa la diffusione iniziale del virus.

[burian br]

Bene ragazzi. La Cina ha pubblicato in soli 7 giorni i genomi di Pechino, e ora sono disponibili alla comunità scientifica globale.

Segnalo quanto sto per scrivere a @snowaholic che proprio ieri si diceva sicuro che la Cina avrebbe messo a disposizione i genomi.

Il virus cinese appartiene al clade 20B. E' confermata dunque l'indiscrezione per la quale il virus causa dell'episodio di Pechino appartiene al ceppo europeo, e specificatamente al sottotipo diffuso in Europa meridionale.
E' pressochè impossibile, però, risalire al luogo di origine del contagio, in quanto il virus pechinese mostra analogie con un virus isolato a Taiwan, e altri isolati in Europa (Rep. Ceca). Di fatto non c'è modo di capirne la provenienza.
Due cose però si possono sostenere:

1. il virus di Pechino mostra parentela con virus europei vecchiotti, nel senso che è molto simile ai virus che circolavano in Europa tra fine Marzo e inizio Aprile, più di due mesi fa. Possiamo ipotizzare, volendo, un quadro in cui il virus sia giunto in Cina nella prima metà di Maggio e sia stato trasmesso da qualcuno che è a sua volta stato infettato da un soggetto che ha avuto un lungo periodo di incubazione, motivo per il quale ha serbato per quasi due settimane, come criogenizzato, un virus un po' "antico" che però ha potuto diffondersi quando già i suoi eredi avevano "soppiantato" i loro virus-antenati.
2. sono stati isolati tre virus a Pechino, di cui uno dall'ambiente. Esiste un certo grado di divergenza genetica, segno che il virus a Pechino è circolato abbastanza da mutare, anche se non molto.

Queste informazioni però non permettono di essere certi nè sulla datazione del virus, nè sulla possibile estensione del focolaio di Pechino, nè sul modo in cui possa esserci arrivato.
Ma adesso faccio due riflessioni e due conti.

Ho scoperto, da quest'articolo (Mainland China reports 32 new coronavirus cases, 25 of them in Beijing | Deccan Herald) che in Cina non sono conteggiati gli asintomatici che risultano positivi al tampone.
Nelle giornate di ieri e l'altro ieri ne avrebbero trovati 13. Ma non comunicati perchè appunto senza sintomi.
Al momento, i positivi comunicati nei dati che compaiono sulle statistiche mondiali sono 200 circa, di cui 11 sono finiti in TI.

Ora: in Cina la popolazione è abbastanza giovane (85% delle persone con meno di 60 anni). Il tasso di asintomatici non è trascurabile per niente.
Non contarli equivale a ridurre financo alla metà il numero di reali contagiati.
I sospetti che il focolaio sia sorto un mese c'è anche nella mente degli esperti cinesi, proprio basandosi sull'alto numero di asintomatici:

‘Lot of asymptomatic cases’: Top China infection expert on Covid-19 cluster - world news - Hindustan Times

Possiamo ipotizzare che per 200 sintomatici ce ne possano essere altrettanto asintomatici. E siamo a 400 almeno. In evoluzione.
Intanto che vi scrivo scoperti altri 2 positivi nell'Hebei, altra regione cinese. Sempre connesso al focolaio del mercato di Xingfadi.
La stima di almeno 400 contagi potrebbe essere confermato, se vogliamo, indirettamente tramite il numero di ricoverati in TI: 11.
In Cina, data la popolazione, dovrebbe finire in TI circa il 2-3% dei positivi. La stima che si ricaverebbe sarebbe dunque un bacino di casi pari tra 370 e 550.

La mortalità in Cina dovrebbe essere attorno all'1%. Dato che utilizzano le TI per via della situazione ancora tranquilla, il tasso di mortalità potrebbe rassomigliare a quello extra-Hubei di Febbraio: appena lo 0,4%.
Questo significa che non stupisce il fatto non abbiano avuto morti. In teoria dovrebbero vederne almeno 2 a breve, e se accadrà significa che il possibile bacino potrebbe essere di 500 persone. E se si aggiungiassero altri morti, anche superiore.

Ribadisco dunque la stima che feci qualche giorno fa basandomi sulla presenza di casi esportati: il focolaio potrebbe contare tra 2000 e 5000 casi. Vado per i 2000 più che verso i 5000.

[burian br]

Stamane vi dò il buongiorno con altri studi scientifici succulenti :

Clinical and immunological assessment of asymptomatic SARS-CoV-2 infections | Nature Medicine

Dei ricercatori cinesi hanno analizzato i livelli sierici di anticorpi in 37 pazienti asintomatici che erano stati diagnosticati nel distretto di Wanzhou a Febbraio e osservati per 14 giorni negli ospedali.
A distanza di 2-3 mesi, il livello di anticorpi IgG nel siero è stato rilevato "in calo". Un modello matematico ha suggerito che l'immunità potrebbe essere di breve durata.

Ciononostante, come ho letto nell'articolo del New York Times da cui sono venuto a conoscenza di questo studio, questa ricerca NON è conclusiva. Inoltre non tiene conto dell'immunità cellulare e del fatto che nonostante bassi livelli di anticorpi le cellule B della memoria (un sottotipo di linfociti B) potrebbero produrre, in caso di un nuovo contatto con il virus, grandi quantità di anticorpi sul momento.

[burian br]

Infine, questa immagine è tratta da uno studio giapponese che raccoglie le informazioni circa i luoghi di contagio dei casi che hanno registrato da Gennaio ad Aprile:

Screenshot_2020-06-19 EavMYRXUMAAjSN1 (immagine JPEG, 679 × 391 pixel).png

Principale luogo di contagio gli ospedali. Fuori dai nosocomi, un ruolo predominante hanno avuto palestre, bar e ristoranti.
Non indifferente anche la quota legata a eventi musicali o cerimonie funebri.

[burian br]

Altri 5662 casi in Messico (tot. 165.455) e +667 morti (tot. 19.747).

Già solo con quei casi, e fissando una mortalità tra lo 0,8 e lo 0,9%, in Messico potrebbero esserci almeno 2,3 milioni di positivi!!

Città del Messico ha annoverato 5042 decessi ufficiali.
Questo articolo (molto approfondito!) ne parla nei dettagli riportando in 7360 i decessi in eccesso a Città del Messico tra il 1° Aprile e il 20 Maggio, di cui solo 1832 censiti.
Ad oggi, solo guardando a quelli censiti, ne andrebbero aggiunti 2210!
Possiamo stimare che a Città del Messico siano morte, in realtà, almeno 9570 persone fino ad oggi. Probabilmente il numero è anche molto più alto, superiore ai 10mila non di poco...ma usiamo questa prima stima.

Sempre col medesimo tasso di mortalità tra 0,8 e 0,9%, i casi nella capitale sarebbero 1,1 milioni!
Ovvero il 13% della popolazione!

[burian br]

A Nembro, a Marzo e Aprile, sono morte 167 persone.
Nel 2019, a Marzo e Aprile, ne morirono 23.
Un eccesso di mortalità dunque di +144 persone. Impressionante.

Nembro aveva 11.616 abitanti stando ai dati del 2017. Ciò significa che è morto in due mesi l'1,4% della popolazione.
Fissando il tasso di mortalità al 2,7%, a Nembro si sarebbero infettati in 5400 persone. Quasi il 50% della città.


Ad Alzano Lombardo tra Marzo e Aprile 2020 sono morte 123 persone. Nel 2019, medesimo periodo, appena 18.
Un eccesso di mortalità di +105 persone.
Alzano ha 13700 abitanti. Ha perso quasi l'1% della sua popolazione. Si sarebbe infettato almeno il 33% della popolazione.

[burian br]

Nel bergamasco, i comuni più colpiti comunque sarebbero stati Leffe e Gazzaniga dove, dai dati dei decessi e con una mortalità del 2,7%, si sarebbero infettati il 50-53% degli abitanti!!

[Matëlmaire]

Nello studio di Cogne voglio poi capire come verranno conteggiati i positivi.

Per adesso nei referti sanitari non se ne fa cenno e rimangono i soliti positivi da due settimane... è questo che mi fa capire che il sistema di valutazione delle positività è completamente sballato, quando vedo la Lombardia (e credo anche l'Emilia-Romagna) che va a buttare tutto nel calderone, anche chi risulta positivo ai sierologici.

[FunMBnel]

Ma infatti, boh, di colpo è come se avessero riempito i pronto soccorsi ai livelli d'emergenza di pieno picco.

Premesso che ovviamente i motivi possono essere vari, non sottovaluterei l'aspetto psicologico: siamo campioni mondiali del salto della quaglia da "liberi tutti" a "tutti a chiamare il 118 al primo starnuto"...

[FunMBnel]

Ma, da Lab24 ci leggono?!?!?

Hanno appena corretto...pfiu, mi era preso un colpo!!!!

Allegato 530761

Meglio va.